Ở thế hệ mới, MT-09 nhận được một số thay đổi về ngôn ngữ thiết kế, trang bị lẫn động cơ. Kích thước tổng thể của mẫu xe này là 2.090 x 795 x 1.190 mm (dài x rộng x cao), chiều dài cơ sở 1.430 mm.
Yamaha MT -09 dùng bộ khung sườn Deltabox, kiểu dáng của mẫu nakedbike này được tạo hình theo hướng phong trần và mạnh mẽ.
Hệ thống treo trước và sau trên MT-09 thuộc thương hiệu KYB. Hành trình giảm xóc trước là 130 mm, giảm xóc sau là 122 mm. Hệ thống phanh trước dùng đĩa phanh kép 298 mm kết hợp cùng cặp kẹp phanh 4 piston hướng tâm.
Phần đầu xe của mẫu mô tô này thiết kế khá gọn gàng với đèn chiếu sáng chính dùng bóng LED kết hợp gương cầu, hai bên là dải đèn định vị ban ngày. Thiết kế này giúp phần đầu chiếc xe trông dễ nhìn hơn cặp đèn chiếu sáng lớn ở thế hệ cũ.
Yamaha trang bị cho MT-09 màn hình tốc độ TFT với kích thước 3,5 inch.
Phần yên xe có thiết kế thoải mái cho người lái, tuy nhiên chiều cao 825 mm chỉ phù hợp với người lái cao từ 1,7 m.
Sức mạnh của MT-09 đến từ động cơ CP3, dung tích 890 cc , làm mát bằng dung dịch. Khối động cơ này có khả năng tạo ra công suất 119 mã lực tại 10.000 vòng/phút, mô-men xoắn cực đại 93 Nm tại 7.000 vòng/phút.
Về hệ thống an toàn , mẫu xe này được trang bị bộ sang số nhanh 2 chiều. Cảm biến IMU 6 trục hỗ trợ cho các công nghệ như kiểm soát lực kéo, kiểm soát trượt bánh sau, chống bốc đầu và kiểm soát lực phanh động cơ.
Trong phân khúc nakedbike 900 cc, Yamaha MT -09 cạnh tranh với Kawasaki Z900 (288 triệu đồng) hay Triumph Street Triple RS (435 triệu đồng).
